La chiesa di San Francesco fu edificata sulla preesistente Chiesetta di San Rocco, di cui si ignora la data di fondazione. Nel 1580 l’agiata famiglia dei Villaraut decise di ingrandire la chiesa concedendola ai Minori Conventuali che dopo il loro arrivo la dedicarono al Santo.

La chiesa, in pietra bianca, ha un suo fascino e infonde una sensazione di antico e di austero, conforme allo spirito del poverello di Assisi.

La chiesa è dotata di due porte: una principale in bronzo, le cui ante sono divise  in quattro riquadri che richiamano la celebre Lauda delle Creature; l’altra laterale si apre a settentrione  raffigurante il Santo che predica agli uccelli.

Vi sono numerose decorazioni, stucchi ed ori nella volta, nelle pareti e nelle cappelle. Ancora oggi ai due lati del presbiterio sono visibili i mausolei della famiglia Villaraut, costruiti con lo stesso marmo dell’altare maggiore.